高性能解決方案

分子動力學

分子動力學大多為數據并行計算,這非常適合在GPU(圖形處理單元)上運行,現在的GPU包含數千個運算單元,可以用來計算密集型的科學應用,為分子建模提供巨大的加速。有效的GPU計算的關鍵是數據并行算法, 目前常見的分子動力學軟件NAMD, VMD, LAMMPS, AMBER, GROMACS等均已發布支持GPU計算的版本,科研人員在不修改軟件的情況下,利用GPU可以立即獲得7-10倍于主流CPU的計算速度。

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